La Chiesa di San Tommaso da Villanova si trova nel centro storico di Castel Gandolfo, e si affaccia su Piazza della Libertà vicino alle Ville Pontificie, luogo di villeggiatura storica di molti papi.
Papa Alessandro VII Chigi commissionò la costruzione della chiesa a Gian Lorenzo Bernini nel 1658. Il progetto prevedeva una cappella annessa al palazzo papale e inizialmente doveva essere dedicata a san Nicola da Bari, invece poi si decise di dedicarla a San Tommaso da Villanova canonizzato proprio nell'anno di inizio lavori della collegiata. La costruzione e la decorazione con gli stucchi di Antonio Raggi sono durate fino al 1661, anno della consacrazione.
